Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms