Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HK3P52790 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HK3P52790 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HK3P52790 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HK3P52790 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HK3P52790 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HK3P52790 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HK3P52790 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HK3P52790 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HK3P52790 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HK3P52790 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms