Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLK1P49759 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms