Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOBEC1P41238 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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