Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL1P40616 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms