Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms