Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms