Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms