Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCAP28676 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms