Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLD1P28340 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLD1P28340 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms