Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PLNP26678 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PLNP26678 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PLNP26678 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PLNP26678 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PLNP26678 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PLNP26678 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PLNP26678 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PLNP26678 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms