Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO2P25791 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO2P25791 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO2P25791 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO2P25791 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO2P25791 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO2P25791 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO2P25791 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO2P25791 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms