Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms