Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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