Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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