Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH2P19022 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH2P19022 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH2P19022 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms