Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAV1P15498 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAV1P15498 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAV1P15498 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAV1P15498 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAV1P15498 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAV1P15498 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAV1P15498 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
VAV1P15498 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAV1P15498 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAV1P15498 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAV1P15498 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAV1P15498 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAV1P15498 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAV1P15498 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAV1P15498 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAV1P15498 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAV1P15498 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms