Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPGDP15428 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPGDP15428 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPGDP15428 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPGDP15428 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HPGDP15428 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPGDP15428 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPGDP15428 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPGDP15428 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPGDP15428 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HPGDP15428 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HPGDP15428 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HPGDP15428 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HPGDP15428 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HPGDP15428 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HPGDP15428 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HPGDP15428 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HPGDP15428 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HPGDP15428 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HPGDP15428 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HPGDP15428 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HPGDP15428 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPGDP15428 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPGDP15428 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDP15428 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDP15428 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDP15428 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDP15428 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HPGDP15428 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms