Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PEPDP12955 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PEPDP12955 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PEPDP12955 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PEPDP12955 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PEPDP12955 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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PEPDP12955 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PEPDP12955 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PEPDP12955 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PEPDP12955 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PEPDP12955 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PEPDP12955 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PEPDP12955 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PEPDP12955 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PEPDP12955 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PEPDP12955 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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PEPDP12955 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PEPDP12955 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PEPDP12955 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PEPDP12955 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PEPDP12955 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PEPDP12955 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PEPDP12955 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PEPDP12955 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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