Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLBP06746 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLBP06746 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLBP06746 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLBP06746 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLBP06746 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms