Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX7O95931 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX7O95931 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX7O95931 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX7O95931 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX7O95931 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms