Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF4O60810 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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