Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGSM2O43147 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGSM2O43147 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms