Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms