Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRTO14522 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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