Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms