Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms