Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-2B6SEH9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms