Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDR42E2A6NKP2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms