Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms