Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA6A0AVT1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA6A0AVT1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms