Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms