Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SNX13Q9Y5W8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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SNX13Q9Y5W8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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