Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms