Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRPF3Q9ULD4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms