Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLH3Q9UHC1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms