Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms