Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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MIS18AQ9NYP9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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MIS18AQ9NYP9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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MIS18AQ9NYP9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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MIS18AQ9NYP9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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MIS18AQ9NYP9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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MIS18AQ9NYP9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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MIS18AQ9NYP9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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MIS18AQ9NYP9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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