Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms