Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN4Q9NQP4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms