Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms