Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARD6AQ9NPB6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms