Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms