Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms