Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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