Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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