Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms