Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC106Q9BWC9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms