Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZBED2Q9BTP6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms