Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms